MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 74307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008340	G	6	6	135540	135545	0 %	0 %	100 %	0 %	114319283
3002	NC_008340	TGG	2	6	135578	135583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319283
3003	NC_008340	GCCG	2	8	135585	135592	0 %	0 %	50 %	50 %	114319283
3004	NC_008340	GC	3	6	135625	135630	0 %	0 %	50 %	50 %	114319283
3005	NC_008340	CG	3	6	135631	135636	0 %	0 %	50 %	50 %	114319283
3006	NC_008340	GAG	2	6	135680	135685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319283
3007	NC_008340	GAG	2	6	135728	135733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319283
3008	NC_008340	GGGT	2	8	135747	135754	0 %	25 %	75 %	0 %	114319283
3009	NC_008340	ATA	2	6	135914	135919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114319284
3010	NC_008340	CG	3	6	135922	135927	0 %	0 %	50 %	50 %	114319284
3011	NC_008340	CGC	2	6	135946	135951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319284
3012	NC_008340	CTGG	2	8	136101	136108	0 %	25 %	50 %	25 %	114319284
3013	NC_008340	CTG	2	6	136168	136173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319284
3014	NC_008340	GAT	2	6	136206	136211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319284
3015	NC_008340	GCA	2	6	136227	136232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319284
3016	NC_008340	TGA	2	6	136253	136258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319284
3017	NC_008340	GCG	2	6	136269	136274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319284
3018	NC_008340	CTC	2	6	136302	136307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319284
3019	NC_008340	GAG	2	6	136330	136335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319284
3020	NC_008340	CTG	2	6	136360	136365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319284
3021	NC_008340	CAC	2	6	136392	136397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319284
3022	NC_008340	TGC	3	9	136415	136423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319284
3023	NC_008340	CTGG	2	8	136437	136444	0 %	25 %	50 %	25 %	114319284
3024	NC_008340	GTG	2	6	136471	136476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319284
3025	NC_008340	CTG	2	6	136492	136497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319284
3026	NC_008340	CCG	2	6	136500	136505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319284
3027	NC_008340	CGC	2	6	136557	136562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319284
3028	NC_008340	CCA	2	6	136659	136664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319284
3029	NC_008340	CGG	2	6	136725	136730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319284
3030	NC_008340	CCGGG	2	10	136760	136769	0 %	0 %	60 %	40 %	114319284
3031	NC_008340	GGC	2	6	136812	136817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319284
3032	NC_008340	AAG	2	6	136819	136824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319284
3033	NC_008340	CAG	2	6	136840	136845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319284
3034	NC_008340	CGG	2	6	136883	136888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319284
3035	NC_008340	CTG	2	6	136897	136902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319284
3036	NC_008340	GC	3	6	137018	137023	0 %	0 %	50 %	50 %	114319284
3037	NC_008340	ACCTGA	2	12	137042	137053	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	114319284
3038	NC_008340	GTC	2	6	137088	137093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319284
3039	NC_008340	TTG	2	6	137134	137139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319284
3040	NC_008340	CGC	2	6	137145	137150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319284
3041	NC_008340	CCG	2	6	137196	137201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319284
3042	NC_008340	GCA	2	6	137229	137234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319284
3043	NC_008340	CGA	2	6	137247	137252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319284
3044	NC_008340	TCGA	2	8	137293	137300	25 %	25 %	25 %	25 %	114319284
3045	NC_008340	GC	3	6	137316	137321	0 %	0 %	50 %	50 %	114319284
3046	NC_008340	CGG	2	6	137412	137417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319284
3047	NC_008340	TGA	2	6	137478	137483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319284
3048	NC_008340	TGG	2	6	137633	137638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319284
3049	NC_008340	GAC	2	6	137706	137711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319284
3050	NC_008340	CGA	2	6	137721	137726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319284
3051	NC_008340	GC	3	6	137781	137786	0 %	0 %	50 %	50 %	114319284
3052	NC_008340	TCG	2	6	137849	137854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319285
3053	NC_008340	CTT	2	6	137856	137861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319285
3054	NC_008340	CGG	2	6	137951	137956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319285
3055	NC_008340	TGC	2	6	137960	137965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319285
3056	NC_008340	GGC	2	6	138030	138035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319285
3057	NC_008340	CCG	2	6	138059	138064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319285
3058	NC_008340	GGT	2	6	138107	138112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319285
3059	NC_008340	GGCG	2	8	138152	138159	0 %	0 %	75 %	25 %	114319285
3060	NC_008340	CTG	2	6	138190	138195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319285
3061	NC_008340	GTG	2	6	138229	138234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319285
3062	NC_008340	TGG	2	6	138274	138279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319285
3063	NC_008340	TAA	3	9	138396	138404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114319285
3064	NC_008340	GCC	2	6	138405	138410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319285
3065	NC_008340	GCTG	2	8	138436	138443	0 %	25 %	50 %	25 %	114319285
3066	NC_008340	TGG	2	6	138453	138458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319285
3067	NC_008340	CTA	2	6	138471	138476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319285
3068	NC_008340	TGC	2	6	138510	138515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319285
3069	NC_008340	ACGA	2	8	138518	138525	50 %	0 %	25 %	25 %	114319285
3070	NC_008340	TGGA	2	8	138643	138650	25 %	25 %	50 %	0 %	114319285
3071	NC_008340	AG	3	6	138661	138666	50 %	0 %	50 %	0 %	114319285
3072	NC_008340	GGT	2	6	138686	138691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319285
3073	NC_008340	GATG	2	8	138741	138748	25 %	25 %	50 %	0 %	114319285
3074	NC_008340	GGTTC	2	10	138753	138762	0 %	40 %	40 %	20 %	114319285
3075	NC_008340	GGC	2	6	138776	138781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319285
3076	NC_008340	GCT	2	6	138805	138810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319285
3077	NC_008340	CTA	2	6	138887	138892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319286
3078	NC_008340	TAA	2	6	138917	138922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114319286
3079	NC_008340	TG	3	6	138939	138944	0 %	50 %	50 %	0 %	114319286
3080	NC_008340	AGG	2	6	139171	139176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319286
3081	NC_008340	GCA	2	6	139224	139229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319286
3082	NC_008340	TGA	2	6	139244	139249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319286
3083	NC_008340	TGA	2	6	139280	139285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319286
3084	NC_008340	GGGT	2	8	139308	139315	0 %	25 %	75 %	0 %	114319286
3085	NC_008340	GTTG	2	8	139357	139364	0 %	50 %	50 %	0 %	114319286
3086	NC_008340	TA	3	6	139385	139390	50 %	50 %	0 %	0 %	114319286
3087	NC_008340	CAA	2	6	139392	139397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319286
3088	NC_008340	TCT	2	6	139461	139466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319286
3089	NC_008340	GGA	2	6	139481	139486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319286
3090	NC_008340	AAG	2	6	139494	139499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319286
3091	NC_008340	CCA	2	6	139547	139552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319286
3092	NC_008340	GTG	2	6	139573	139578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319286
3093	NC_008340	ATA	2	6	139603	139608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114319286
3094	NC_008340	AG	3	6	139672	139677	50 %	0 %	50 %	0 %	114319286
3095	NC_008340	TAG	2	6	139678	139683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319286
3096	NC_008340	AGA	2	6	139712	139717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319286
3097	NC_008340	CTG	2	6	140861	140866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319287
3098	NC_008340	AGC	2	6	140867	140872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319287
3099	NC_008340	GCGGG	2	10	140873	140882	0 %	0 %	80 %	20 %	114319287
3100	NC_008340	TCA	2	6	140888	140893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319287
3101	NC_008340	CGG	2	6	140895	140900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319287
3102	NC_008340	TTC	2	6	140914	140919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319287
3103	NC_008340	CTGC	2	8	140943	140950	0 %	25 %	25 %	50 %	114319287
3104	NC_008340	CTG	2	6	140984	140989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319287
3105	NC_008340	GCT	2	6	141091	141096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319287
3106	NC_008340	ACC	2	6	141152	141157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319287
3107	NC_008340	ACG	2	6	141282	141287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319287
3108	NC_008340	CAG	2	6	141297	141302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319287
3109	NC_008340	GCC	2	6	141341	141346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319287
3110	NC_008340	GTG	2	6	141386	141391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319287
3111	NC_008340	ACC	2	6	141459	141464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319287
3112	NC_008340	CAGC	2	8	141502	141509	25 %	0 %	25 %	50 %	114319287
3113	NC_008340	ACG	2	6	141512	141517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319287
3114	NC_008340	CTT	2	6	141520	141525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319287
3115	NC_008340	GCT	2	6	141544	141549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319287
3116	NC_008340	CTG	2	6	141557	141562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319287
3117	NC_008340	GGC	2	6	141610	141615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319287
3118	NC_008340	C	6	6	141619	141624	0 %	0 %	0 %	100 %	114319287
3119	NC_008340	GC	3	6	141665	141670	0 %	0 %	50 %	50 %	114319287
3120	NC_008340	CGG	2	6	141697	141702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319287
3121	NC_008340	GCC	2	6	141805	141810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319287
3122	NC_008340	GGA	2	6	141811	141816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319287
3123	NC_008340	GTG	2	6	141872	141877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319287
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3125	NC_008340	TGG	2	6	141939	141944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319287
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3142	NC_008340	CGG	2	6	142703	142708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319288
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3230	NC_008340	GC	3	6	146813	146818	0 %	0 %	50 %	50 %	114319291
3231	NC_008340	CGGT	2	8	146856	146863	0 %	25 %	50 %	25 %	114319291
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3242	NC_008340	TGA	2	6	147280	147285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319291
3243	NC_008340	GGC	3	9	147305	147313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319291
3244	NC_008340	CCGAG	2	10	147319	147328	20 %	0 %	40 %	40 %	114319291
3245	NC_008340	GTG	2	6	147336	147341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319291
3246	NC_008340	TGG	2	6	147370	147375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319291
3247	NC_008340	CA	3	6	147379	147384	50 %	0 %	0 %	50 %	114319291
3248	NC_008340	GCGG	2	8	147392	147399	0 %	0 %	75 %	25 %	114319291
3249	NC_008340	AGC	2	6	147646	147651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319291
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3251	NC_008340	TGG	2	6	147706	147711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319291
3252	NC_008340	ACC	2	6	147787	147792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319291
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3257	NC_008340	CTG	2	6	148040	148045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319291
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3264	NC_008340	GGT	2	6	148437	148442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319292
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3271	NC_008340	CGG	3	9	148622	148630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319292
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3273	NC_008340	GCC	2	6	148714	148719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319292
3274	NC_008340	CCCAG	2	10	148776	148785	20 %	0 %	20 %	60 %	114319292
3275	NC_008340	CT	3	6	148834	148839	0 %	50 %	0 %	50 %	114319292
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3350	NC_008340	GCC	2	6	152336	152341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319294
3351	NC_008340	GC	3	6	152347	152352	0 %	0 %	50 %	50 %	114319294
3352	NC_008340	CCA	2	6	152361	152366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319294
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3356	NC_008340	G	6	6	152425	152430	0 %	0 %	100 %	0 %	114319294
3357	NC_008340	GGTG	2	8	152441	152448	0 %	25 %	75 %	0 %	114319294
3358	NC_008340	CGT	3	9	152584	152592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319295
3359	NC_008340	ATG	2	6	152601	152606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319295
3360	NC_008340	TGA	2	6	152629	152634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319295
3361	NC_008340	ACC	2	6	152640	152645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319295
3362	NC_008340	GC	3	6	152725	152730	0 %	0 %	50 %	50 %	114319295
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3364	NC_008340	GCG	2	6	152870	152875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319296
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